大多数哥伦比亚大学的本科生和研究生在位于纽约市晨边高地的主校区学习——根据塞斯·洛十九世纪晚期的观点，大学所有的教学任务都应该可以在一个校园内完成。校园由麦金姆—米德—怀特(McKim, Mead, and White)公司的建筑师们采用布杂风格(Beaux-Arts principles)的设计思路主持设计。校区占地超过六个街区，32英亩(13公顷)。哥伦比亚大学在晨边高地拥有7,800套公寓，用来提供给教职工以及研究生们居住;另外几乎所有的二十余个本科生公寓(包括起初即设计为学生公寓的建筑以及后来改作学生公寓的建筑)都位于校园附近或晨边高地地区。学校拥有发达且历经一个世纪的地下隧道系统，最古老的部分甚至要早于晨边高地的主校区。其中有一些仍然对公众开放，而其余部分则已经被封锁了起来。

晨边高地校区的许多建筑被列入了美国国家史迹名录。作为美国国家历史地标以及校区核心的的洛氏纪念图书馆因其重要的建筑价值被收入该名录。哲学楼(Philosophy Hall)则因为其作为调频收音机发明地的原因被收录。另外一个美国国家历史地标，同时是物理系与天文系所在地的普平楼也被收入了美国国家史迹名录，人类历史上第一次铀裂变的实验就是在这里，于丹麦哥本哈根完成的人类历史上第一次原子分裂的十天后，由恩里科·费米主持进行。

“校园台阶”(The Steps)，或者称为“洛氏台阶”(Low Steps)、“城市海滩”(Urban Beach)，是一个非常受哥伦比亚大学学生们欢迎的会面地点。这是一段连接校园低地部分(即南校园，South Field)与地势较高部分的大理石台阶。受城市美化运动启发的这一设计为哥伦比亚大学及其附属学院的学生及教职工的日常聚会，活动与大型仪式提供了舒适与宽敞的户外空间。同时麦金姆公司经典的洛氏图书馆正面设计是十九世纪晚期新古典主义风格设计的一个缩影。作为洛氏图书馆的入口，庄重的古典风格石柱和门廊无不显示其装饰建筑的重要性。气候温暖宜人的时候，洛氏台阶经常成为学生们享受日光浴，午餐与玩飞盘的理想去处。

2007年4月，大学购买了位于晨边高地校区以北曼哈顿维尔的一个工业区超过三分之二，约17英亩(6.9公顷)的土地。这块从125街延伸至133街的新校区计划容纳哥伦比亚大学的商学院(Business School)，国际与公共事务学院(School of International and Public Affairs，SIPA)，以及主要研究神经退行性疾病，例如帕金森氏症和阿尔茨海默氏症的莫蒂默·B·扎克曼心智、大脑与行为研究学会(Mortimer B. Zuckerman Mind Brain Behavior Institute)。这一涉及70亿美元资金的扩展计划包括拆毁除三处有历史价值的建筑以外的所有建筑，清除区域内所有的轻工业和仓库，以及重新安置132幢公寓的租户，最后这一区域将为哥伦比亚大学增加6,800,000平方英尺(630,000平方米)的校园面积。但基于从财产保护、公平交换土地到维护居民权的许多理由，西哈勒姆(West Harlem)区的社区活动团体反对大学的这一扩张计划[55][56]。随后举行的听证会听取了周围社区的反对意见。后来，纽约州的帝国州发展公司(Empire State Development Corporation)通过表明曼哈顿维尔地区的萧条现状获得了该地块的使用权，并且在2008年12月得到了政府部门给予的，为了发展公共事业使用私人财产的权利[57]。2009年5月20日，纽约州公共机构管理理事会(New York State Public Authorities Control Board)批准了学校在曼哈顿维尔的扩大计划。2016年10月24日，新校区举行了落成典礼，同时莫蒂默·B·扎克曼心智、大脑与行为研究学会与伦费斯特艺术中心(Lenfest Center for the Arts)也正式开始向校区内首座建筑，杰罗姆·L·格林科学中心(Jerome L. Greene Science Center)进行搬迁。杰罗姆·L·格林科学中心预计于2017年春正式运营。